Protein–RNA interactions for Protein: Q9UM22

EPDR1, Mammalian ependymin-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPDR1Q9UM22 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
EPDR1Q9UM22 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
EPDR1Q9UM22 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms