Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULK4

MED23, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 23, humanhuman

Predictions only

Length 1,368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED23Q9ULK4 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MED23Q9ULK4 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
MED23Q9ULK4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms