Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
ZNF608Q9ULD9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC34.01■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.04
ZNF608Q9ULD9 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
ZNF608Q9ULD9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms