Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CROTQ9UKG9 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CROTQ9UKG9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms