Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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RABGEF1Q9UJ41 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
RABGEF1Q9UJ41 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
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RABGEF1Q9UJ41 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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RABGEF1Q9UJ41 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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RABGEF1Q9UJ41 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RABGEF1Q9UJ41 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RABGEF1Q9UJ41 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
RABGEF1Q9UJ41 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
RABGEF1Q9UJ41 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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RABGEF1Q9UJ41 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RABGEF1Q9UJ41 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RABGEF1Q9UJ41 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RABGEF1Q9UJ41 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RABGEF1Q9UJ41 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
RABGEF1Q9UJ41 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
RABGEF1Q9UJ41 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
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