Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGV2

NDRG3, Protein NDRG3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDRG3Q9UGV2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NDRG3Q9UGV2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms