Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBZ4

APEX2, DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase 2, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APEX2Q9UBZ4 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
APEX2Q9UBZ4 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
APEX2Q9UBZ4 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms