Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0L9

PKD2L1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 805 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L1Q9P0L9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PKD2L1Q9P0L9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PKD2L1Q9P0L9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms