Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYZ1

TVP23B, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TVP23BQ9NYZ1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
TVP23BQ9NYZ1 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms