Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYL9

TMOD3, Tropomodulin-3, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3Q9NYL9 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TMOD3Q9NYL9 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TMOD3Q9NYL9 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms