Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY43

BARHL2, BarH-like 2 homeobox protein, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BARHL2Q9NY43 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
BARHL2Q9NY43 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
BARHL2Q9NY43 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms