Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXW9

ALKBH4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALKBH4Q9NXW9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ALKBH4Q9NXW9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALKBH4Q9NXW9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALKBH4Q9NXW9 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALKBH4Q9NXW9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALKBH4Q9NXW9 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALKBH4Q9NXW9 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALKBH4Q9NXW9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALKBH4Q9NXW9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALKBH4Q9NXW9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALKBH4Q9NXW9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALKBH4Q9NXW9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALKBH4Q9NXW9 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALKBH4Q9NXW9 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALKBH4Q9NXW9 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALKBH4Q9NXW9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALKBH4Q9NXW9 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALKBH4Q9NXW9 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALKBH4Q9NXW9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ALKBH4Q9NXW9 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms