Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVX2

NLE1, Notchless protein homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLE1Q9NVX2 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
NLE1Q9NVX2 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
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