Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TRMT13Q9NUP7 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TRMT13Q9NUP7 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms