Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU39

FOXD4L1, Forkhead box protein D4-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L1Q9NU39 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FOXD4L1Q9NU39 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 LIAS-205ENST00000509519 1005 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 AC092131.1-201ENST00000564046 548 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
FOXD4L1Q9NU39 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.9 ms