Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSQ0

RRP7BP, Putative ribosomal RNA-processing protein 7 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.63■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC30.61■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.49
RRP7BPQ9NSQ0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RRP7BPQ9NSQ0 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms