Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF275Q9NSD4 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms