Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
PLXNA4Q9HCM2 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PLXNA4Q9HCM2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms