Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
LIN28AQ9H9Z2 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms