Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7E2

TDRD3, Tudor domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD3Q9H7E2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TDRD3Q9H7E2 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TDRD3Q9H7E2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms