Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZJ0

CRNKL1, Crooked neck-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRNKL1Q9BZJ0 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CRNKL1Q9BZJ0 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CRNKL1Q9BZJ0 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms