Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC4A5Q9BY07 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC4A5Q9BY07 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms