Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
BBS2Q9BXC9 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
BBS2Q9BXC9 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms