Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
KATNB1Q9BVA0 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
KATNB1Q9BVA0 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms