Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NDUFAF3Q9BU61 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms