Protein–RNA interactions for Protein: Q99613

EIF3C, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3CQ99613 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
EIF3CQ99613 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms