Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SLC22A12Q96S37 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms