Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q91

SLC4A9, Anion exchange protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A9Q96Q91 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC4A9Q96Q91 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC4A9Q96Q91 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms