Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
LMTK3Q96Q04 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
LMTK3Q96Q04 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms