Protein–RNA interactions for Protein: Q96MI9

AGBL1, Cytosolic carboxypeptidase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGBL1Q96MI9 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AGBL1Q96MI9 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms