Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CAPZA3Q96KX2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CAPZA3Q96KX2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms