Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
LINC00208Q96KT6 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms