Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ5

MS4A4A, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4A, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A4AQ96JQ5 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MS4A4AQ96JQ5 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MS4A4AQ96JQ5 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms