Protein–RNA interactions for Protein: Q96JJ7

TMX3, Protein disulfide-isomerase TMX3, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX3Q96JJ7 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMX3Q96JJ7 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMX3Q96JJ7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMX3Q96JJ7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMX3Q96JJ7 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMX3Q96JJ7 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMX3Q96JJ7 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMX3Q96JJ7 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMX3Q96JJ7 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMX3Q96JJ7 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMX3Q96JJ7 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMX3Q96JJ7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMX3Q96JJ7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMX3Q96JJ7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMX3Q96JJ7 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMX3Q96JJ7 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMX3Q96JJ7 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMX3Q96JJ7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMX3Q96JJ7 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMX3Q96JJ7 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMX3Q96JJ7 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMX3Q96JJ7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
TMX3Q96JJ7 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms