Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
MS4A3Q96HJ5 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 CCDC152-202ENST00000388827 1237 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AC121493.1-201ENST00000602316 450 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AC068985.1-201ENST00000463297 703 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AC055748.1-201ENST00000489836 959 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 AC009118.3-201ENST00000622896 873 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MS4A3Q96HJ5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms