Protein–RNA interactions for Protein: Q96EU6

RRP36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP36Q96EU6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
RRP36Q96EU6 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
RRP36Q96EU6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms