Protein–RNA interactions for Protein: Q96ES7

SGF29, SAGA-associated factor 29, humanhuman

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Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGF29Q96ES7 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SGF29Q96ES7 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SGF29Q96ES7 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
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