Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GCC1Q96CN9 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GCC1Q96CN9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms