Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC23■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
VTI1AQ96AJ9 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
VTI1AQ96AJ9 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms