Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC47Q96A33 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms