Protein–RNA interactions for Protein: Q96A19

CCDC102A, Coiled-coil domain-containing protein 102A, humanhuman

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC102AQ96A19 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CCDC102AQ96A19 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CCDC102AQ96A19 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms