Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
PRG4Q92954 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
PRG4Q92954 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
PRG4Q92954 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms