Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
TSC1Q92574 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TSC1Q92574 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms