Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TTLL11Q8NHH1 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TTLL11Q8NHH1 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms