Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCS4

TMEM35B, Transmembrane protein 35B, humanhuman

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Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM35BQ8NCS4 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM35BQ8NCS4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM35BQ8NCS4 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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