Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
USP38Q8NB14 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
USP38Q8NB14 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms