Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
FSIP1Q8NA03 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FSIP1Q8NA03 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms