Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9L1

ZIC4, Zinc finger protein ZIC 4, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC4Q8N9L1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ZIC4Q8N9L1 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ZIC4Q8N9L1 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms