Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
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CLIP4Q8N3C7 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
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CLIP4Q8N3C7 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CLIP4Q8N3C7 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
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