Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SYCP3Q8IZU3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SYCP3Q8IZU3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms